1. ทุนอุดหนุนการวิจัยประเภททั่วไป เป็นทุนสนับสนุนที่ให้แก่สถาบันการศึกษา และหน่วย งานวิจัยในภาครัฐ ซึ่งเสนอโครงการวิจัยและพัฒนา เพื่อขอรับทุนอุดหนุนการวิจัยโดยไม่จำกัดหัวเรื่อง แบ่งเป็น 2 ด้านคือ
      - การวิจัยเพื่อมาตรฐานผลิตภัณฑ์อาหาร เพื่อศึกษาข้อมูลทางวิทยาศาสตร์ อันเป็นเอกลักษณ์หรือคุณลักษณะของผลิตภัณฑ์อาหารไทย ซึ่งจะนำไปสู่แนวทางในการปรับปรุงมาตรฐานผลิตภัณฑ์อาหารที่มีอยู่ให้ดีขึ้น หรือใช้เป็นข้อมูลสำหรับผลิตภัณฑ์อาหารที่ยังไม่มีมาตรฐานรองรับ
      - การวิจัยเพื่อพัฒนาผลิตภัณฑ์อาหาร เพื่อศึกษาวิจัยซึ่งนำไปสู่การพัฒนาผลิตภัณฑ์ใหม่ จากวัตถุดิบหลัก ของประเทศ ผลพลอยได้หรือของเสียจากโรงงาน เป็นต้น หรือพัฒนากระบวนการผลิตให้มีประสิทธิภาพยิ่งขึ้น เพื่อนำไปสู่การถ่ายทอดให้กับภาคการผลิต
   
2. ทุนอุดหนุนการวิจัยประเภทผลิตนักวิจัยรุ่นใหม่ เป็นทุนสนับสนุนที่ให้เฉพาะสถาบันการศึกษา ซึ่งเสนอโครงการวิจัยและพัฒนาเพื่อการพัฒนาผลิตภัณฑ์ใหม่และพัฒนากระบวนการผลิตให้มีประสิทธิภาพยิ่งขึ้น เพื่อขอรับทุนอุดหนุนการวิจัยโดยไม่จำกัดหัวเรื่อง

1. ทุนอุดหนุนการวิจัยประเภทผลิตนักวิจัยรุ่นใหม่ จะต้องผลิตนักศึกษาปริญญาโทหรือปริญญาเอกอย่างน้อย 1 คน ต่อ 1 โครงการ (หากเป็นนักศึกษาปริญญาโท ใช้ระยะเวลาโครงการไม่เกิน 2 ปี เป็นนักศึกษาปริญญาเอก ใช้ระยะเวลาไม่เกิน 3 ปี วงเงินงบประมาณที่เสนอขอ จะไม่มีค่าตอบแทนคณะผู้วิจัยและค่าจ้างผู้ช่วยวิจัย)
   
2. ทั้ง 2 ประเภท ต้องส่งรายงานความก้าวหน้าทุกๆ 6 เดือน นับจากวันที่เริ่มต้นโครงการฯ ที่ระบุไว้ในสัญญา จำนวน 5 ชุด พร้อมดิสเก็ตต์
   
3. ทั้ง 2 ประเภท ต้องส่งรายงานการวิจัยและพัฒนาฉบับสมบูรณ์ จำนวน 5 ชุด พร้อมดิสเก็ตต์ หลังจากเสร็จสิ้นการวิจัย

1. การวิจัยทาง computational (in silico) biology ของข้าวและพืชต่างๆ
2. การวิจัยทางชีวเคมีและสรีรวิทยาของข้าว ทั้งในสภาพปกติและสภาวะเครียดต่างๆ รวมทั้งกลไกการเกิดโรคและพยาธิสภาพต่างๆ ของข้าว
3. การพัฒนาการใช้เทคโนโลยีหลังจีโนมของข้าวและพืชอื่นๆ เช่น DNA microarray, proteomics, protein modeling และ metabolomics เป็นต้น
4. การพัฒนาเทคโนโลยีการปรับปรุงสายพันธุ์ข้าว โดยใช้ Marker Assisted Selection และ Hybrid rice technology โดยเฉพาะอย่างยิ่งการปรับปรุงที่ทำให้ข้าวมีคุณค่าทางอาหารสูงและมีผลผลิตสูง
5. การพัฒนาเทคโนโลยีที่เกี่ยวข้องกับเมล็ดพันธุ์ข้าวและเมล็ดพันธุ์พืช

 โดยที่ทั้ง 3 ทุนมีงบประมาณและหน่วยงานที่ติดต่อดังต่อไปนี้